Bueno me has pillado en plena mudanza de vacaciones y no he podido responderte antes, ya lo siento.
Bueno ahi muchas maneras de hacer lo que tu dices, pero en todo caso a no ser que quieras volver a instalar linux vas a tener que hacer 2 cosas:
1- Redimensionar el disco para asignarle el espacio que necesites del que te quede libre para una particion NTFS
2-Instalar un gestor de arranque que reconocoza los 2 sistemas operativos despues de instalar windows porque perderas el arranque de linux.
Para lo primero si que se puede hacer normalmente con las herramientas de aprticionado que bienen incluidas en linux, no tengo mucha experiencia con Ubuntu pero con la distribución Wifiway 1.0 con el programa GParted si que te deja.
Si te lias mucho y no encuentras el programita o no te deja en linux usa alguna herramienta especifica para ello como las muchas que te vienen en el Hyrens Boot CD, ya sabes quemas la imagen ISO en un CD y arrancas desde el CD, luego redimensionas y ya cuando arranques con windows te reconocera la particion y te dejara formatear en NTFS:
Toma el enlace con las descargas:
http://www.taringa.net/posts/downloads/843684/Hiren_%27s-BootCD-9_1.html
Y luego para el gestor de arranque pues facilmente en linux lo vuelves a instalar o instalas uno a tu elección eso no tiene tampoco mucho lio, pero si no lo logras tambien puedo recomendarte algun gestor de arranque como este que es gratuito:
http://icepack-boot-manager.softonic.com
Saludos y para cualquier duda pregunta, siento haber tardado tanto en contestar