Como es lógico el MI6 está presente en todas las películas de James Bond, pero eso supongo que ya lo sabías. La verdad es que no conozco demasiadas en las que se nombre o esté de por medio el servicio de inteligencia británico, pero aquí te dejo alguna:
"Duplicity": http://www.abandomoviez.net/indie/pelicula.php?film=2352
"Tercera identidad": http://www.abandomoviez.net/indie/pelicula.php?film=10195
Episodio 6 de la serie "La Movida": http://www.imdb.com/title/tt1598657/
La serie "Contraataque": http://www.filmaffinity.com/es/film262520.html
En este episodio de "Ley y Orden": http://www.sensacine.com/series/serie-73/temporada-586/#12698
"El desafío de las águilas": http://www.filmaffinity.com/es/user/rating/508897/619330.html debes ver la crítica completa.
"El invitado": http://es.wikipedia.org/wiki/Safe_House
"El molino negro": http://www.filmaffinity.com/es/film135934.html
Ahí te he dejado algunas, si necesitas alguna más me lo dices aquí mismo y te doy más información.