Alga Negra en liner, no se quitan las motas negras

Estoy tratando una piscina de LINER con manchas negras, se ha super clorado y después se tallan las manchas, le ponemos un producto de amplio espectro para los tres tipos de alga, los puntos ya se quitaron pero quedan algunos en la costura del liner, ¿pueden sugerirme que más puedo hacer?