Eliminar algas con oscuridad y cloración

Hola, después de pelearme con las algas este verano en una piscina de 40m3, filtrado de 6 horas, pasando el limpiafondos y cepillado cada 5 días, he realizado una última limpieza y colocado la cubierta opaca. Mi pregunta es: si dejando la filtración/cloración 15 días a 6 horas con la cubierta opaca, ¿se acabarán muriendo algas, y no tendré sorpresas desagradables cuando quite la lona el verano próximo?.

Pasado el periodo de 15 días reduciría la filtración al mínimo 15min o 30min al día.