Comparación de ondas

Hola experto!
En mi trabajo tengo un problema en el que quiero comparar la desviación en varios puntos, por encima o por debajo respecto a una línea basal, entre dos conjuntos de datos. Es una medida del grosor a lo largo de una plancha, las ondulaciones pueden ser por encima o por debajo del eje central y las mediciones se toman en los mismos puntos para los dos conjuntos. He pensado que mi problema se asemeja a una posible onda, por lo que creo que necesitaría comparar ondas. Aunque no tengo mucha idea de ondas (o nada, todo se quedó en primero de carrera), creo que podría asemejarse a comparar dos ondas en fase, porque las mediciones se realizan en el mismo punto, pero cada "onda" tendría distinta amplitud en todos los puntos medidos. ¿Existe alguna metodología que me compare las amplitudes de dos ondas y me diga qué puntos de las ondas son diferentes entre sí y que me cuantifique la diferencia? Si la comparación fuese estadística (es decir, que me dé cierta signifación de la diferencia detectada) sería muy útil.
Espero haberme explicado
Gracias!