Instalación de Linux

Hola experto, son varias las preguntas que tengo acerca de como instalar linux. Tengo instalado en mi pc Windows 98 SE en un disco duro, tengo otro de menor capacidad en el que me gustaría instalar Linux pero quisiera poder contar también con el Windows, no sé cómo hacer para instalar, tampoco se como iniciar con uno o con otro, tengo duda también sobre cómo debo poner los puentes de Master/Slave en ambos discos. Desde ya muchas gracias...