Markus,
Perdona la la espera, según me cuentas ese fallo en la transmisión puede deberse a múltiples posibilidades, básicamente casi todos por desgaste.
Primero que nada comprobaría estos elementos:
Desgaste de cadena:
http://www.mountainbike.es/front/noticia/%C2%BFCU%C3%81NDO-TENGO-QUE-CAMBIAR-LA-CADENA?/2c90a88c20330b1c012033652793000e
Desgaste de piñones y o platos, es posible que algún plato principalmente el que mas se usa, el medio pueda doblarse y ocasionar esos molestos saltos que pueden acabar con tu rodilla en la potencia...
Descartado esto, o si has cambiado alguno-todos estos componentes tras una buena limpieza de toda la transmisión con desengrasante, posterior engrase y ajuste de cambios(conveniente revisar cables y fundas) no deberías de tener este problema. La suciedad acumulada, acelera el desgaste es importante que mantengas la bici limpia y engrasada para que en el futuro no te vuelva a ocurrir. También importante anticipar los cambios y no hacer cambios de marcha en esos momentos de máximo esfuerzo que pueden dar como resultado un salto de pedal, la rotura de cadena o doblar un plato.