Baja y despido

Hola el 29 de agosto tube que coger la baja por la mutua ya que me hice daño en el trabajo(estaba de ett con un contrato de obra y servicio dsd enero 2011)ayer fui al medico y le dije que me diera el alta,total que me incorparocion seria mañana esta mñn me llama la ett y me dice que ha bajado la faena y que yo y unas cuantas ya no tenemos que volver,hasta ahi bien no?pero me ha dicho que desde el 3 de septiembre hasta el 8 me haran un pago directo(que lo cobrare el mes que viene)y que eso me lo paga la seguridad social,me ha dicho q siempre se hace asi y no si es correcto o no,el caso es que le he preguntado si eso luego me lo descontarian del paro y me ha dicho que no tiene nada que ver,es cierto?gracias.