Despido colectivo y baja médica

Llevo 5 años trabajando en una empresa, hace 3 semanas tuve que coger
baja medica por una enfermedad, hace una semana la empresa ha presentado
un despido colectivo, estamos en periodo de consultas, esperamos este
jueves que todos los empleados acepten una indemnización de 20 días por
año, ya que la empresa presenta perdidas.
mi pregunta es, este periodo de baja me afecta a la hora de cobrar la
indemnización, y a la hora de cobrar el paro?, sólo cobro el 75% del
sueldo estando de baja.
muchísimas gracias de antemano, espero que mi pregunta sea clara y me haya explicado bien.