¿Nombre comercial o marca registrada?

Hola
si en la empresa, tienes registrado un nombre comercial ya; pero por ejemplo, quieres emitir facturas con el logotipo y demas de un servicio (si, iran los datos fiscales de la sociedad tambien) ¿se puede hacer con una marca registrada o deberia ser nombre comercial? ¿Se puede tener mas de un nombre comercial?
La idea es emitir distintos formatos de factura (repito, si iran los datos fiscales de la sociedad) para los distintos servicios (distinto logo, etc ) y distinta numeracion. Eso queria saber, si tiene que ser con nombre comercial o marca registrada y que diferencia hay entre ambas. Gracias
saludos