Calculo de IT

Tengo un trabajador en baja por accidente laboral, pero tras las pruebas realizadas, la Mutua ha considerado que el daño se ha producido por enfermedad común y le han dado el alta. Ahora tiene que ir a su médico de cabecera donde se supone que le dará de nuevo la baja, pero ya por enfermedad común.

¿Como cuento los tramos a la hora de calcular la IT por enfermedad común? ¿A partir de la baja inicial o a partir de la baja por enfermedad común? No hay un alta por mejora, sino por cambio de criterio...

Gracias!!