Datos de una tabla sin clave principal

Hola

Tengo varias tablas sin clave principal.

Resulta que ahora, al tratar de optimizar la base de datos, me encuentro con que si pongo clave principales, -necesarias para el proyecto que tengo entre manos- no puedo usar los datos ( son cientos)

Quisiera saber si hay forma de arreglar el desaguisado

Gracias!

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