Problemas de textos

Hola y gracias por los servicios que prestas.
Mi pregunta es, porque razón trabajo en mc uno proyecto en diurector, los textos salen bien en referencia a acentos, paso a un pc win 98 para hacer el proyector pc y todo bien, pero al checar mi cd en una pc win 2000 o XP los acentos salen mal con signos extraños, quisiera una respuesta pues termine una enciclopedia de yucatán con miles de fichas de textos y es un trabajo de más de un año, a pesar de utilizar tipografía helvética eque es común y recomendada por director.
Gracias