Poner contraseña Internet Explorer

Lo que podes hacer es usar algo como Folder Guard y poner bajo protección el directorio del Internet Explorer:
http://www.winability.com/
El problema es que lo que puedes bajar de allí es una demo.
Otra cosa que podes hacer es ir a Herramientas -> Opciones de Internet... y en la parte de opciones activar el Content Advisor (no sé como es en castellano y mi IE está en inglés) para limitar lo que quienes usen tu navegador puedan hacer.

Por lo que yo sé, no existe ninguna utilidad específica para poner un password a Internet Explorer. Lo que hay así qe te pueda servir es algo de aquí : http://www.webattack.com/Freeware/security/fwaccess.shtml
http://www.webattack.com/Shareware/security/swaccess.shtml
De la segunda página hay alguna que sirve para evitar que se ejecute Internet Explorer.
Mira a ver cual te va mejor a tus necesidades.

Una forma de hacerlo es entrando al registry de cada maquina y alterar la parte de internet explorer, es algo que se me ocurre pero que no se como podría hacerlo.
La otra forma es que reemplaces el ieplorer.exe por otro archivo con el mismo nombre y si es posible, que sea del mismo tamaño y con eso solucionado, así te evitas comprar software caro ;)

Una forma de hacerlo es encriptar el ejecutable del internet explorer (iexplore.exe), por ejemplo usando crypt320 (http://www.weiss-home.de/download/crypt320-x.exe)
Este programa te permite encriptar ficheros y archivos (incluso ejecutables)
Cada vez que quieras ejecutarlo, debes hacerlo con un click derecho sobre él y desencriptarlo con la password. Es una forma indirecta pero efectiva.