¿Qué versión de .net utilizar?

Hola!
Tengo que hacer la tesis de mi carrera (Analista de sistemas) y no se que lenguaje puedo utilizar.
Se programar en Visual Basic 6, lo he aprendido en el colegio.
.net como mínimo. Pero no se que versión de .net puedo utilizar o que otro lenguaje que no sea tan complica(ya que mi base es VB6).
La bases de datos que debo utilizar es SQL server. (Otra pregunta ¿MSQL, es muy distinta?)
Desde ya muchas gracias.
La información que me puedas brindar puede ser muy importante para mi.