Lo más seguro es que te falten archivos de emule. No has indicado cual era tu sistema operativo, ni tu version de emule.
Yo lo que haría es:
Dirígete a esta página y bajate el software de emule pero con el instalers.
http://vcheck.emule-project.net/en/download.phpEs decir:
Esta version eMule v0.30a Installer (3.8 MB). Y te lo instalas. Luego reinicias el ordenador y lo pruebas.
Ten en cuenta que si tenias descargas pendientes en el emule anterior, estas se pueden perder si no instalas el emule en el mismo directorio en el que tenias el anterior emule.
Para que esto no te ocurra haz lo siguiente:
Instala emule 0.30 en donde el se instala por defecto, que es, archivos de programa/emule
Luego cuando esté instalado coge los archivos de las carpetas icomming y temp del emule viejo que tenias e introducelos dentro de las carpetas icomming y temp del emule que acabas de instalar.
Te preguntará si quieres sobrescribir, ponle que si, así no pierdes las descargas cuando hayas hecho esto puedes volver a reinstalar el emule, y al abrirlo tendrás las descargas tal y como estaban en tu antiguo emule.
Luego si en el panel de control no te aparece el programa del emule viejo para desinstalarlo. Puedes ir al directorio donde lo tenias y eliminar toda la carpeta. El emule viejo ya no sirve para nada.