Eliminar win2000

Tengo 3 discos en mi pc, en"C" el win98, y en "E" el win2000, he formateado el "E" para borrar el win 2000, pero aun aparece en la pantalla de opciones de que S.O. Deseo usar.
Que puedo hacer para borrarlo, solo deseo seguir con mi win98.
Gracias anticipadas.
Luis Colan