El formato del que me hablas es NTFS.
Windows 2000 (al igual que XP) dispone de un conversor de particiones FAT32 a NTFS con la intención de que quien se actualice desde Windows 98 o Me, pueda transformar sus particiones a NTFS sin tener que formatear. Sin embargo, no se contempla la opción inversa, puesto que las particiones NTFS tienen mejor rendimiento y seguridad. Por lo que tendrás que recurrir a utilidades de terceros, como Partition Magic de PowerQuest. descargalo de la siguiente url:
http://www.hispazone.com/Detalle.asp?IdPrograma=57Si aún pues es la única que también soporta las particiones NTFS de Windows XP, Con este programa bastará con que pulses con el botón derecho del ratón en una partición y elija Convertir..., la única opción disponible para cambiar el sistema de archivos es FAT32, por lo que con pulsar Aceptar comenzará la conversión.