Daño en registro de windows

Hola a todos, tengo un inconveniente, cambie mi board es una gfxcel pc 133, en 3 ocasiones he formateado la maquina para instalar win98se y 3 veces me ha salido error del registro de windows, reiniciándose la maquina para corregir el registro pero pierdo todo el software instalado y nuevamente hay que reconfigurar todo.
Cual es la posible solución o es que mi board esta causando conflicto físico.
Gracias