Primero te debes plantear para que quieres unir esos dos servidores. W2k está diseñado para eso. Puedes unirlos en un mismo dominio en un árbol con dos dominios diferentes o en un bosque de varios dominios. Si te refieres como utilizar el directorio activo para crear relaciones de confianza entre los dos servidores, es tan simple como pinchar acción establecer relación de confianza. De todas formas sé un poco más especifico.