Scanner con abby finder de una determinada manera

Hola buneas. Se puede escanear con abby finder de una determinada manera. Me explico yo tengo un montón de páginas que no quiero que me escanee el encabezado y el pie de página ya que son todos iguales y no guardan información. Me pueden indicar los pasos a seguir para realizar este proceso ya sea en este programa o en otro que realice un escaneo ocr decente. Muchas gracias