Entiendo entonces que la factura que te ha remitido Endesa es porque se han dado cuenta de que el contador está manipulado lo que ha motivado que te han estado cobrando menos durante un tiempo. Una vez se han dado cuenta de la manipulación han refacturado para cobrarte los consumos que no te habían cobrado.
En este caso, solo pueden refacturarte los consumos de 1 año anterior. Si la refacturación te incluye periodos de consumo anteriores, no tienes por qué abonarlos.
Si tienes idea de quién hizo la manipulación del contador, puedes denunciarle ante la policía porque manipular los contadores es un delito penal.
Endesa suele permitir pagos fraccionados de estas refacturaciones para facilitar el pago.
Yo de todos modos haría constar por escrito mi reclamación si no lo has hecho ya. Aunque si eres el titular del contrato, tendrás que abonar la refacturación salvo que esté mal hecha.