Trabajo cuenta ajena y administrador SL

Hola:

Actualmente trabajo para una empresa por cuenta ajena y me ofrecen el cargo de administrador único de una SL con el 100% de las acciones (ya soy accionista pero el otro socio no quiere seguir y me ofrece todo sin coste). Mis dudas son varias: 

1. ¿tengo que darme de alta en autónomos? Creo que es obligatorio, no? 

2. ¿Cómo puedo pagarme nómina o beneficios?

3. ¿Cómo tributan estos pagos teniendo en cuenta que se suman a mi retribución por cuenta ajena?