¿Afecta a una subvención de contrato indefinido con tarifa plana el hecho de cambiar la categoría profesional?

Soy dependiente, pero tengo funciones de encargada. Ahora estoy en proceso de negociación para que me suban el sueldo, dado la cantidad de funciones que realizo que no corresponde con mi puesto. Tengo un contrato convertido en indefinido por la subvención de la tarifa plana. Me gustaría saber si el hecho que me cambien de categoría profesional a encargada con su subida de sueldo correspondiente, puede afectar a la subvención de la tarifa plana que se beneficia mi jefe.