Infección vaginal, óvulos y posible embarazo

Después de mi último periodo comencé que con flujo amarillo y con olor. Fui al ginecólogo y me mandó ovulos (pero que los use luego del siguiente periodo) el tema es que llevo 12 días de retraso y sigo con flujo (aunque ya no tiene olor). Me hice un test de embarazo y dice que no lo estoy. Si es así, no entiendo porqué llevo tantos días sin menstruar. Mi última relación sexual fue el 24 de noviembre, no nos cuidamos pero él eyaculo afuera y yo al 3er día tomé la pastilla de emergencia. El siguiente periodo me vino bien, pero ahora no me baja el periodo. No confío mucho en las pruebas de embarazo. Consulté con un doctor y me dijo que comenzara con los óvulos, ¿pero puuedo utilizarlos estando embarazada?