Estoy de baja desde febrero 2016 por una baja medica pero a fecha de hoy debería ser laboral

Como decía estoy de baja desde febrero de este año mi baja fue por dolores cervicales una protusión discal c5 y c6 que pasa ahora me han detectado el túnel carpiano de las dos manos conclusión me tienen que operar de las tres cosas. Esto es producto de la misma faena que hago, ahora mi pregunta yo quiero negociar con la empresa mi despido y el paro para este mes que viene en abril la empresa nos subrogó a otra empresa y yo como sigo de baja no se que es trabajar con ellos, ¿pregunto? Tendría que coger el alta que pienso hacerlo en mis quince días de vacaciones y ahí pactar mi despido, para capitalizar el paro y ponerme un negocio.