Baja maternidad en prórroga por ir

Espero podáis ayudarme ya que estoy un poco perdida en esto y la incertidumbre me mata...

Me han concedido la prórroga de seis meses después de llevar un año de baja, pues próximamente me realizarán ya pruebas concluyentes a lo que me pasa que puede ser fibromialgia, me he quedado embarazada y realmente no sé que tengo que hacer pues cuando se me acabe la prórroga de 6 meses que pasara con la baja de maternidad? ¿Sería conveniente que cuando se me realicen las pruebas y se me diagnostique lo que sea me coja el alta voluntaria y después cuando me corresponda mi baja por maternidad me la den por ese motivo? Realmente yo quiero saber que me pasa y recuperarme no kiero llegar a la posibilidad de que me den una incapacidad que aún así creo que es bastante complicado...