Cambio de motor 1.9d F8Q, problemas?

Es un poco largo, pero ruego se lea para entender qué problema tengo.

Tengo un Suzuki Samurai 1.9d del 2002, el coche tenía 172000kms cuando la junta culata se fue, de hecho estuvo andando 30000 kms generando chapapote en el vaso de expansión pero, como el coche había sido regalado, pues pensé cuando rompa, ha roto,... El caso es que a medida que pasó el tiempo le fui cogiendo cariño, hasta el punto que, cuando cascó la junta, decidí cambiársela, tengo algo de conocimientos de mecánica, y la operación, en sí, no es difícil..

El caso es que tras cambiar la junta de culata, hacerle la distribución, que me aseguré dando varias vueltas que las marcas seguían coincidiendo y nada golpeaba, cuando lo fui a arrancar, este lo hizo sin problema, mientras me regodeaba y me alegraba, empezó a cabecear, quise creer que esto era por algún problema con los inyectores ya que estuvieron fuera del motor un tiempo y posiblemente se habían deteriorado, el coche tenía presión de aceite, estaba bien de temperatura (más bien bajo), y los cabeceos seguían, cuando le aumentaba el régimen, regulaba bien, pero sacaba humo de gasoil mal quemado entre blanco y gris... No olía a aceite... Cuando lo volvía a dejar al ralentí, cabeceaba como una cosa mala...

Paré el motor y comprobé de nuevo la distribución, sin ningún problema aparente, las marcas seguían coincidiendo, no había síntomas de ningún diente saltado y giraba sin chocar con nada...

Lo volví a arrancar y seguía el cabeceo, hasta que al cabo de un minuto con un ruido como si se hubiera enganchado hierro con hierro, se paró de golpe (de hecho, es lo que pasó)

Me frustró mucho, pero era un riesgo que estaba dentro del saco y quise achacarlo en que la operación del cambio de junta la fui haciendo a ratos perdidos, y el motor, aunque más o menos tapado, estuvo abierto mucho tiempo quise creer que igual no había estado en las mejores condiciones y cierta contaminación por polvo o partículas pudieron afectarlo.

Decidí comprar un motor de desguace, garantizado y comprobado, por lo que aparentemente está en correcto funcionamiento, este motor está aprox 3 días en mi taller antes de empezar a montarlo y tardo una semana en hacerlo y arrancarlo, todo esto tras adaptar todos los periféricos del motor original al adquirido ya que aunque son el mismo motor, algunos elementos no coincidían, léase cárter, soporte bomba inyectora, colector escape, y alguna tontería más, pero lo que es la parte de bloque y culata son iguales.

El caso es que tras arrancarlo, igual que el anterior, arrancó a las mil maravillas, ralentí estable, ruído típico de ese diesel en frío,... Un leve "tuc tuc" que el otro siempre hizo, en definitiva, un sonido correcto...

Se verifica en varias ocasiones que efectivamente, la luz de presión de aceite está apagada, el circuito de refrigeración está lleno y sin burbujas, y la temperatura había alcanzado escasamente su nivel mínimo.

Y vuelve a cabecear...

Lo paro inmediatamente, compruebo la distribución, todo correcto, gira bien, las marcas coinciden, no se engancha con nada..., miro a ver si hay alguna fuga de aceite, por el filtro, por el cárter, abro la tapa de válvulas, miro a ver si hay alguna leva marcada, si hay aceite arriba, todo correcto...

Vuelvo a ponerlo en marcha y se mantiene cabeceando, lo vuelvo a parar...

Miro los testigos de temperatura que tiene el motor por si ha habido algún conato de gripaje, imposible, ni siquiera tienen marca del mínimo de temperatura, el motor está prácticamente frío.

La pregunta para los expertos: ¿Qué puede ser? Aunque sé que es difícil emitir un diagnóstico sin ver y/o escuchar el motor pero la pregunta es esa.

¿Es posible que se produzca el mismo fallo con esa diferencia de circunstancias?, ¿Qué debo comprobar antes de volverlo a arrancar?, ¿Cómo puedo saber si los inyectores inyectan correctamente?, ¿Cómo puedo saber que no hay un taqué enganchado? La distribución está aparentemente bien, sin embargo, ¿hay alguna otra manera de comprobarla que no sea simplemente girando la correa para ver si coinciden las marcas? ¿Qué es ese leve "tuc tuc" que me recuerda los antiguos mercedes om de los autobuses? ¿Hay manera de comprobar cilindros y bielas sin desmontar todo el motor?

En fin, perdón por el ladrillo, pero tenía que explicar la situación.