Aislar los cajones de las persianas

Quiero aislar los cajones de las persianas porque entra bastante frio., pero no se si al poner el islamiento va a interrumpir la conexión entre el mando y la antena que va en el interior del cajón. ¿Alguien me puede decir si lo puedo poner...? ¿Y en caso de que pueda ponerlo me podéis decir cuál es el mejor material?