¿Quien paga mi baja y mi autónomo?

Acabo de cumplir un año de baja, soy autónoma y hasta hoy tanto mi baja como el pago del autónomo lo ha pagado mi Mutua. Ahora me mandan al INSS que debe contactar conmigo, supuesta mente antes de un mes, para ver como se resuelve mi caso. Yo estoy en lista de espera para operación y el médico dice que una posibilidad es que se prolongue 6 meses más la baja.

Mi pregunta es ¿Quién me va a pagar ahora la baja y el autónomo? ¿El importe a cobrar es el mismo? ¿Durante el periodo hasta que el INSS me llame cobraré?