Compensar horas no trabajadas en paga extraordinaria

Quizás se trate de una pregunta sencilla, pero me genera dudas.
¿Es posible sustraer de la paga extraordinaria una cantidad correspondiente a horas que la persona trabajadora ha trabajado "de menos"? En la situación actual de COVID19, algunos trabajadores han estado sin venir a prestar sus servicios durante unos días, por acuerdo expreso con la empresa, y ahora deben recuperar o compensar estas horas no trabajadas, y una de las posibilidades planteadas es descontar el importe correspondiente de la paga extra, ¿es correcto?