No entiendo muy bien lo que dices. Para borrar la última línea de un archivo podría valer esto:
@echo off
Setlocal EnableDelayedExpansion
Echo tratando %1
del /q temp.txt>nul 2>&1
for /f "tokens=*" %%i in ('type %1 ^| find /v /c "" ^< %1') do set nlin=%%i
set /a nlin-=1
for /f "usebackq tokens=*" %%i in (%1) do if not "!nlin!" == "0" echo %%i>> temp.txt&set /a nlin-=1
copy /y temp.txt %1>nul
del temp.txt
Endlocal
Si lo salvas, por ejemplo, como BORULTLIN.BAT y lo invocas de esta manera:
borultlin archivo.txt
Te borrará la última línea del archivo ARCHIVO.TXT (además eliminaría las líneas en blanco si existieran, pero este "defecto" se podría subsanar).
Pero no consigo entender, en este contexto, como puede interesar el nombre del archivo si has tenido que indicárselo al BAT.