Cobrar estando de baja médica por contingencias comunes.

Estoy en situación de baja laboral por contingencias comunes (sin hospitalización ni intervención) desde el pasado 03 de febrero de 2021. Mi base de cotización del mes anterior a la baja, es decir, enero, es de 2134,85 euros (ahí ya van incluidas las pagas extraordinarias prorrateadas), lo que corresponde una base reguladora de 68,9 euros y así me informa de Mutua correspondiente. Ya sé que del 4º al 21º me corresponde cobrar el 60% y a partir del 21º el 75%. Hasta aquí todo correcto y perfecto. Mi duda es la siguiente. En mi Convenio Colectivo consta que a partir del trigésimo primer día de baja mi empresa tiene que completar hasta el 100% del salario real. ¿Qué es el salario real?, ¿Cuánto debería cobrar? Es que hay cosas que no me cuadran. En mi última nómina de abril mi base de cotización sigue siendo los 2134,85 euros y sobre esta cifra me descuentan la cuota obrera o aportaciones a la Seguridad Social como corresponde, pero me figura BASE IRPF 1763 que es igual al total devengado 1763 y de aquí me descuentan el 17% de irpf, el total a percibir lógicamente es inferior ¿Todo esto está correcto?, ¿Cuál sería el salario real que debería cobrar? ¿Es normal que mi cuota obrera se calcule sobre 2134,85 cuando yo no estoy cobrando esa cifra? En mi Convenio consta que el tiempo de IT consta como tiempo efectivo de trabajo ¿me correspondería la paga extra de junio?