Pago de autónomos por parte de la empresa

Necesito que alguien me explique todo lo relacionado con el pago de autónomos por parte de la empresa.

La empresa está formada por tres socios y cada uno de ellos tiene una nómina. Aunque son autónomos percibe su nómina y los seguros sociales de los autónomos también los paga la empresa. Además tienen una cantidad como retribución en especie.

Me urge saber todo lo relacionado con este tema, asientos contables, liquidación de autónomos por parte de la empresa, pago de retribución en especie, ¿y compensación por parte de la empresa en impuestos como paga esos autónomos?

Por favor, me pueden contestar y explicarme todo este tema pues mi jefe quiere que le haga una explicación de todo esto pero en ninguna empresa que he estado se daba esta situación.

Quedo a la espera de cualquier respuesta que puedan darme y quedo profundamente agradecido por su respuesta con la explicación.