Baja laboral por enfermedad no laboral

Estuve trabajando en una empresa haciendo una baja laboral como unos 16 meses .

El junio tuve diflofia me parece se dice, vista doble y tuve que coger la baja el día 9 de junio, pero el día 23 de ese mismo mes le dieron el alta a la persona y como faltaba yo se puso a trabajar en vez de coger las vacaciones.

Estoy cobrando por la mutua y ya el día 22 de septiembre me dan el alta pues se complicó la cosa .cuando me den el alta puedo solicitar el paro que tuve acumulado durante esos 16 meses? O me lo quitan de mi paro esos meses que estuve cobrando.