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Lo que se me ocurre es cambiar el hub o switch al que se conectan tus usuarios por uno gestionable, y utilizar una capacidad que tienen algunos de poder limitar el ancho de banda de la conexión.

Lo más seguro el que el firewall te haya cortado ciertos puertos TCP con los que trabaje Netmeeting. Tendrías que averiguar que puertos son con los que trabajas y después dejarlos pasar en el Firewall.