¿Se puede desprogramar el coche y descontrolar los mandos por cambio de batería?

el otro día compre un seat ibiza 20002 1.4 ,,esta muy buen estado pero por estar parado no tenia batería y procedimos a poner la de otro coche...al ponerla recuerdo que pego un chispazo pero en fin,,,cuando me di cuenta después cuando me lo lleve que el ordenador de abordo estaba loco y los mandos del aire también,,,esto puede haber sido por haber hecho este cambio?a que se puede deber esta desprogramacion del coche?me indica una luz de avería electrónica de motor o algo asi,,,,,