No creo que en la madera agarren ni el yeso ni el cemento. Prueba con un listón de madera de un ancho y grosor adecuados, y termina de rellenar los posibles huecos con masilla para madera. Usa también masilla para cubrir el agujero redondo que se aprecia en la foto. Todo esto, claro, suponiendo que luego vayas a pintar la puerta... Si piensas dejarla en el tono actual, la masilla y los listones quedarán, aunque los tiñas, más bien como pegotes... A lo mejor ya lo tienes resuelto, pero, ¿por qué no te limitas a poner un cristal sobre la puerta, para poder utilizarla como mesa?. No sé si la foto engaña, pero a mí me parece una tabla muy bonita, tal como está. Yo me limitaría a cubrir el agujero con masilla del mismo tono, lijaría esa zona, limpiaría bien la puerta de restos de cera antigua y la enceraría de nuevo, o le daría un barniz incoloro, mate o satinado. En fin, disculpa si me meto donde nadie me llama...