Apuntes de Física propiamente dichos, tal como los entendemos para seguir las asignaturas que se imparten en la carrera, no creo que se puedan conseguir en Internet, principalmente porque su extensión hace que sea muy laborioso volcar en la red los cientos de páginas que conforman una sola asignatura. La mejor forma de conseguirlos es directamente en las Facultades de Ciencias Físicas; existen bolsas de apuntes en las delegaciones de alumnos con apuntes cedidos por alumnos, que se pueden fotocopiar. Es fácil encontrar apuntes de los primeros cursos aunque escasean o simplemente faltan de asignaturas de los últimos cursos. Lo mismo se aplica a apuntes de Aeronáutica, en la Escuela Superior de Ingenieros Aeronáuticos de la UPM de Madrid (la única de España de momento).
Sin embargo, sí hay excelentes páginas web con explicaciones muy buenas sobre Física. Te adjunto algunas direcciones de páginas web que te pueden ser útiles; te recomiendo especialmente la primera de ellas porque es muy didáctica e incluye muchos "applets" que facilitan mucho la comprensión de los fenómenos físicos.
Física con ordenador:
http://scsx01.sc.ehu.es/sbweb/fisica/default.htmHyperPhysics:
http://hyperphysics.phy-astr.gsu.edu/hbase/hph.htmlEn estas otras hay muchos enlaces a páginas de Física:
PhysicsWeb:
http://www.physicsweb.org/
Física y Sociedad:
http://www.fisicaysociedad.es/
Colegio Oficial de Físicos:
http://www.cofis.es/
Real Sociedad Española de Física:
http://www.ucm.es/info/rsef/
En cuanto a Aeronáutica te recomiendo:
See How It Flies (muy buena):
http://www.monmouth.com/~jsd/how/htm/how.html
Rincón Aeronáutico:
http://www.geocities.com/bdelicad/Allstar:
http://www.allstar.fiu.edu/aerojava/Aviation Week:
http://www.aviationnow.com/
Manual de vuelo:
http://inicia.es/de/vuelo/
Aerovía, el Portal de la Aviación.
http://www.aerovia.com/