Comprobar sistema de archivos al iniciar Windows 7

El otro día al encender el portátil me salió un mensaje diciendo que se había apagado mal (no era verdad, ya que la vez anterior se había apagado bien) y cuando iba a encenderse, llegaba hasta la pantalla de inicio y daba un pantallazo azul que decía "Page fault in non paged área", con lo que se reiniciaba y volvía otra vez al principio, saliendo todo el rato lo mismo, así que no llegaba a encenderse, solo en modo a prueba de fallos conseguí intentarlo.
El tema es que hoy he vuelto a encender el ordenador y cuando se estaba iniciando, me ha salido automáticamente que Windows que estaba buscando una solución y que iba a intentar restaurar el sistema. Al final lo ha hecho y el ordenador se ha conseguido encender (estoy ahora utilizándolo y va todo perfecto).
Lo he reiniciado varias veces para ver si me seguía saliendo el pantallazo y nada, ni una vez más... Sin embargo ahora cada vez que enciendo el ordenador me sale el siguiente mensaje:
"Comprobando el sistema de archivos en \\?\volume cdf0b573-6375-11df-9ef0-806 (hay más números, si haría falta los copio todos) El tipo del sistema de archivos es NTFS. La etiqueta de volumen es System. Uno de los discos necesita ser comprobado para ver coherencias.
Se puede cancelar la comprobación de disco, pero se recomienda que continúe. Tiene 10 segundos para omitir la comprobación de disco presionando una tecla."
Sin embargo, aunque presione cualquier tecla la cuenta atrás sigue hasta quedarse en 1s, y no hace nada más. He esperando bastante rato y nada, no se que hacer. Lo que hago es apagarlo y normalmente la siguiente vez se enciende rápido.
He probado a desactivar el checkdisk al iniciar y nada...
Gracias de antemano, un saludo.

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