Partición NTFS

Hola tengo instalado windows XP con un sistema de archivos NTFS, ¿por qué no puedo utilizar todo el espacio del disco duro para esta partición?
Estoy pensado en formatear el disco duro e instalar windows y linux ¿qué partición me convendría más NTFS o FAT32? ¿Qué diferencia hay entre una y otra?