Problema con mi NSR 125 F, del '91

Os presento mi problema y a ver si sabéis cual puede ser el problema. Resulta que compré mi NSR 125 f del año '91 con el motor gripado y con los cojinetes del cigüeñal para cambiar, así que me decidí por comprar un motor de NSR 125 para substituirlo por el mio. Al cambiar el motor me dispuse a hacer unas vueltas de prueba y perfecta casi a la primera. El caso es que cuando estaba casi convencido de que la operación había salido perfecta, dejo la moto en marcha en el local, voy a buscar una llave y al volver la moto se había parado... Desde entonces no he vuelto a poder ponerla en marcha. El tema es que tiene la pinta de ser un problema de chispa, y eso que eh probado de cambiar la bujía, la pipeta y la bobina pero el problema persiste... Así que no se que tocar ya.