Diferencias en % de IVA/ IGIC sobre conceptos "rappels y bonificaciones sobre ventas" año 2012

Hola:
Consulta relacionada con el % de IVA e IGIC correcto a aplicar en rápeles y bonificaciones sobre ventas, después de los cambios a partir de 1/9/2012 en el IVA y 1/7/2012 en IGIC.
Ejemplo del problema: Facturas por servicio de un proveedor y periodo estipulado para la liquidación de rápeles es de [1000 € + 18% IVA] + [1000 € + 21% IVA] + [500 € + 3% IGIC]. Abonos de rappel emitidos por el proveedor y del periodo acordado es de [100 € + 18% IVA] + [100 € + 21%] + [50 € + 3% IGIC] (bases imponibles rápeles suman 250 € ). A su vez, el cliente ha emitido cargo a su favor y por el mismo concepto los 250 € todo +21% IVA (% de aplicación en fecha emisión de su cargo). ¿Cuáles son los rápeles correctos, proveedor o cliente? Dado que el IVA del cargo es superior y no se da ánimo de fraude, sería correcto contabilizar cargo del cliente con el % de gravamen superior (21%) a fin de conciliar los pagos e impuestos? ¿Cómo argumentaríais la operación correcta, la que lo sea?
Gracias y un cordial saludo.