RE intracomunicario IVA consulta

Hola,
Por favor, no consigo una respuesta clara, o explicación, Me sería de infinita ayuda vuestra explicación o respuesta, por favor, ayudadme es muy sencillo.
Estoy en recargo de equivalencia comercio minorista, como bienas para revender a proveedores alemanes. Me envían la mercancía sin IVA. Por ejemplo factura 1000€. A final de año, hago el 309 y pago 222€ de IVA + RE. Estamos a finales de abril el día 20 toca presentar el 130 de IRPF. ¿Contabilizo como gasto esos 222€ del 309?
Si cuando compro a un proveedor español contabilizo factura total (IVA + RE + Base Imp), porqué en una operación intracomunitaria no lo contabilizo también aunque se pague por medio del 309.
Solo eso, gracias de antemano.
Saludos