Iva soportado en melilla

Buenos día, estoy haciendo el IVA trimestral y ahora me encuentro con unas facturas de una estancia del empresario en Melilla y llevan el IVA al 2%, mi pregunta es si lo contabilizo por total factura? Lo tengo que tratar como si fuese una operación intracomunitaria?
Estoy hecho un lío y a contra-reloj.
Gracias por anticipado