¿Cómo pagar el iva?

hace 1 año y 2 meses que tengo un rstaurante con un socio, el local es pequeño solo tenemos 10 mesas, hay gente que me dice que lo mejor para mi negocio es pagar por módulos, yo no entiendo nada de esto, lo único que se es que mi gestoría se ebcarga de este tema y lo único que he pagado en este año han sido 120 euros cada socio mas nuestros autónomos cada mes. Les entrego religiosamente las facturas de compra y los finales de caja. Mi duda es que algo falla, solo eso tengo que pagar? O mi gestoría esta haciendo las cosas mal?