Pagar impuestos por adelantado

Mis padre tiene un estanco de los antiguos. Mi pregunta es ¿puede el pagar todos sus impuestos en base a las compra del proveedor?, quiero decir, al margen de lo que venda. Le llegan las facturas del proveedor y, de los tres trimestres, la lleva a la gestoría y pagan los impuestos de toda esa mercancía (como si la hubiera vendido), se venda o no, y envía también las facturas emitidas a bares y restaurantes, la diferencia es venta por caja. Lo digo porque al ser un estanco antiguo nunca hicieron control de ventas diarias, y la gestoría les hace así, ¿esto es legal?¿podría llegar a tener problemas?