Después de una baja 18 meses - situación vacaciones

Me he reincorporado a mi trabajo después de una baja laboral de 18 meses
diagnostico cáncer de ovario, el pasado 15 de septiembre, trabajo en una agencia de viajes, en un inplant, dept. De empresas, mi puesto ya estaba cubierto, pero el volumen
de trabajo ha aumentado y casualmente habían pedido una persona más, por lo que mi vuelta no parece que haya sido sentado muy bien, y a pesar de no tener espacio suficiente me han hecho hueco en una pequeña mesa en unas condiciones digamos que
no "muy buenas". Pero al comentar que no me parecía muy operativo el puesto de tragbajo, me dice (el responsable de la oficina ) que (tono amenaza-irónico)
Aun no tiene muy claro quien sobra en la oficina, luego pasan a comentar como distribuir el resto de vacaciones del personal, y pregunto que situación es la mía después de la baja, y me contesta que tiene que consultar pero que sera como una parte proporcional
de unos 2 días por mes desde sept hasta diciembre. Me gustaría confirmar si esto es cierto. Ademas también tengo una duda el tribunal medico dictamino alta con fecha 10 de septiembre pero no tenia nada por escrito, fui al centro más cercano iss para pedir una carta y poder incorporme pero me la dieron con fecha 12 sept por lo que me incorpore el 15 lunes, les pregunto que si esos 5 días los paga la mutua o la empresa, y me dicen
que es así la ley y que nadie los paga, yo los pierdo, se pierden días entre firmas y envíos de hecho hoy 16 sept aun no tengo el documento oficial.
¿Es verdad esto o puedo reclamar estos días?
Gracias de antemano por vuestra ayuda, no esta siendo muy fácil la vuelta al trabajo
un saludo