Buenas tardes, compre una finca con una casa en ruinas, al escriturar la obra

Compre una finca con una ruina, ahora he ido a escriturar la obra nueva y me han aconsejado que hiciera una agrupación de la finca y la casa ( que no entendí) pues la ruina ya existía en la finca, entonces nos han hecho escriturar la agrupación ( de la ruina y la finca) y en la misma escritura la obra, pero ha sido como obra antigua pues se termino hace más de 4 años. Hemos pagado el modelo 600 de la agrupación con el valor de la casa vieja. Y el modelo 600 de la obra "antigua" para poder registrar. Hacienda nos reclama la diferencia en la agrupación del valor dado de la casa en ruinas + la finca pues dice que la agrupación la considera después de hacer la casa (por ser obra antigua) y nos reclama la diferencia.

No entiendo porque pues lo de la agrupación nos dijeron que era un mero tramite, cuando la finca ya tenia la edificación.

El caso es que nos reclaman la diferencia que es bastante,

Gracias