MOD 115 factura varios pagos

Buenas tardes, tengo una duda respecto a la modificación del IRPF en profesionales.

Trabajo para un ingeniero y en las facturas ponemos la retención, actualmente 15%.

Tenemos facturas hemos cobrado una parte y queda un resto por cobrar.

Si el cliente paga el resto pendiente en septiembre como queda lo de la retención? La parte que ha pagado retiene al 15% y el resto al 21%?

Saludos y gracias